果要屯田，要不就要重新清理军屯，要么就买地或者开垦一些土地贫瘠的荒地与盐碱地才行。
特别是清理军屯一事，牵扯众多，因此内阁建议在京畿屯田一事，本是蓟辽总督专管。现今蓟辽总督空缺，可选任朝廷重臣为蓟辽总督，负责此事，内阁推举的是吏部左侍郎邹元标。
这让朱由校不得不思考，蓟辽总督权责深甚重，节制顺天保定辽东三抚，蓟州昌平辽东保定四镇。
邹元标是东林党元老，这个人性格刚直，不畏权贵，既然由刘一燝推荐，那说明他们对此事也早有打算。
选用邹元标不是不可以，但东林党人素与熊廷弼不合，万一邹元标与熊廷弼不对付，相互掣肘，这样对辽东战事不利，那就不好了，历史上就是如此。
但蓟辽总督又不能不设置，他想了下，不如专设辽东总督，由熊廷弼担任。
就让邹元标总督京畿，负责屯田与清理军屯一事，这样就不会相互干涉了。
京畿屯田的事有了计较。
下面就是海运的事了，海运的是其实比较难办，不是派一两个人就可以解决的。
原本朱由校计划是在天津卫与登莱等兴建水师，从海上运粮到辽东，以减少损耗，同时还可以登莱等地接济辽南。
这一计划其实朝廷早有筹划。现实的情况是现在天津卫特别是登莱等地，由于多年海禁，现在无人以及船可用。
嘉靖时期，为了防止倭寇，在登辽间开始执行严格的海禁政策，官方采取坚壁清野措施，将山东登莱各岛全部招抚荡平，严格限制民间渔船数量，其余船只全部劈毁。商贩船通行禁止，寸板不许下海，严督沿海官军往来巡哨。
直到万历四十六年，萨尔浒战败后，建虏攻陷抚顺，而辽东仓储粮草已经不足二十万石。
户科给事中官应震（楚党领袖）对辽东军饷情况表示担忧，上书建议从一水之隔的青州登州莱州三府向辽东转运粮饷。当时内阁方从哲也很快得到批准这一题本。
但由于长期以来停罢海运，登莱一带的人已是人不习海久矣，登辽海道封闭时间太久，原有官方运输体系破坏殆尽，各地商人畏惧战乱。
视辽如刀山剑林，视浮海渡辽如扬汤燖毛。把去渡海辽东当做上刀山，热水拔毛一般，都不愿前往辽东运粮。导致重开海运之后，一时间竟出现了这样的情形：
海运初兴，船无一只，水手无一人。渐至深秋，海洋难渡，因出示招募，不论官吏军民，凡能雇觅海船者，即差官押银与彼同往。哪怕出重金悬赏，也是没船没人。
自重开登辽海道到现在将近
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